土木工程学科是浙江省“十三五”一流学科（B类）、“十四五”一流学科（B类），岩土工程是校级优势学科。本学科集科学研究、人才培养、社会服务为一体，注重应用性与创新性相结合，跟踪学科技术发展前沿，与地方企业开展科技研究与开发，为地方培养创新型应用技术人才。本学科具有良好的基础和优势，经过长期的积累，依托古工程保护与地质灾害防治联合研究中心，在岩土工程及防灾减灾工程方面形成了特色和优势。

学院建有工程数智化与智慧监控浙江省工程研究中心、“古工程保护与地质灾害防治联合研究中心”、“衢州市建筑工业化与海绵城市产学研究中心”、“衢州市建设工程质量监督站检测中心学院分中心”等研究中心。建有市级“工程结构保护与应用重点实验室”和“古工程保护及土木工程防灾减灾重点实验室”，校级“结构工程与防灾减灾研究所”和“结构工程”校级重点实验室。浙江省岩土力学与工程学会古地下工程保护专委会挂靠在本学科处。学院实验室面积接近5000m2，教学、科研设备价值4000余万元。实验室内有MTS加载系统、岩石三轴仪、岩石真三轴仪、GDS系列土工试验仪、动三轴仪、压力板仪、冻干机等实验设备，拥有ABAQUS，ANSYS、HYPERMESH等有限元分析软件，具备学科发展的基本软硬件条件。